วัดมหาธาตุตั้งอยู่ในเขตเทศบาลเมืองยโสธร ตำบลในเมือง อำเภอเมืองยโสธร จังหวัดยโสธร วัดมหาธาตุเป็นพระอารามหลวงชั้นตรี โดยมีประวัติความเป็นมาตามที่สมเด็จพระมหาวีรวงศ์ (อ้วน ติสโส) อดีตสังฆนายกได้เรียบเรียงไว้ในประชุมพงศาวดารภาคที่ 70 เมื่อ พ.ศ. 2440 กล่าวว่า เมื่อครั้งที่พระวออพยพหนีภัยสงครามจากเมืองหนองบัวลุ่มภู มาถึงบริเวณที่เรียกว่า “ดงผีสิง” เห็นว่าเป็นชัยภูมิที่ดีจึงได้พักอยู่ระยะเวลาหนึ่ง แล้วแยกย้ายกันไปตั้งบ้านเรือน ซึ่งท้าวหน้า ท้าวคำสิงห์ และท้าวคำผุ ตั้งอยู่บ้านสิงห์ท่า และพร้อมใจกันตั้งวัดขึ้นเพื่อเป็นวัดคู่บ้านคู่เมือง เรียกว่า วัดทุ่งสว่าง ต่อมาเมื่อท้าวหน้าได้รับความดีความชอบเป็น เจ้าพระวิชัยราชขัตติยะวงศา ครองนครจำปาศักดิ์ จึงได้พากันสร้างพระเจดีย์ใหญ่ เรียกว่าพระมหาธาตุ วัดทุ่งสว่างจึงได้ชื่อว่า วัดมหาธาตุ ตั้งแต่นั้นมา
ภายในวัดมีพระพุทธรูปที่สำคัญประดิษฐานอยู่ ได้แก่ พระพุทธบุษยรัตน์ (พระแก้วสีน้ำค้าง) หน้าตักกว้าง 27 เซนติเมตร สูง 7 เซนติเมตร เป็นสมบัติของพระยาวิชัยราชขัตติยะวงศา ที่ได้มาจากบรรพบุรุษเมื่อครั้งอยู่ที่เวียงจันทน์
พระแก้วสีน้ำค้าง
หอไตร จากประวัติทราบว่าสร้างขึ้นในสมัยพระสุนทรราชวงศา (ฝ่าย) ประมาณ พ.ศ. 2373 ซึ่งตรงกับรัชสมัยพระบาทสมเด็จพระนั่งเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 3 เป็นหอไตรที่สร้างขึ้นกลางสระน้ำ หันหน้าไปทางทิศใต้ มีแผนผังรูปทรงเป็นสี่เหลี่ยมผืนผ้า หลังคาซ้อนลดหลั่นกัน 3 ชั้น ประดับด้วยช่อฟ้า ใบระกา หางหงส์ หลังคามุงด้วยกระเบื้องดินเผา ภายในมีห้องเก็บพระไตรปิฎก ผนังห้องด้านนอกตกแต่งด้วยลายรดน้ำ มีประตูและบันไดทางขึ้นอยู่ด้านทิศใต้ ซุ้มประตูห้องเก็บพระไตรปิฎกตกแต่งด้วยไม้แกะสลัก ด้านข้างบันไดเป็นภาพจิตรกรรมทั้ง 2 ข้าง ผนังห้องด้านข้างและด้านหลังเว้นช่องหน้าต่างข้างละ 1 ช่อง หน้าต่างตกแต่งด้วยลายรดน้ำและไม้แกะสลัก ภายในห้องฝ้าเพดานตกแต่งด้วยลายรดน้ำ รวมทั้งเสาและเครื่องไม้อื่นๆ ด้วยเช่นกัน
หอไตร
วัดมหาธาตุได้รับการบูรณะด้วยกัน 2 ครั้ง คือ เมื่อ พ.ศ. 2490 คณะกรรมการอำเภอยโสธรและคณะกรรมการวัด ได้ซ่อมแซมบูรณะวัดมหาธาตุโดยก่อกำแพงแก้วรอบบริเวณพระมหาธาตุ เมื่อ พ.ศ. 2508 ได้มีการบูรณะซ่อมแซมหอไตร และใน พ.ศ. 2551 กรมศิลปากร โดยสำนักศิลปากรที่ 11 อุบลราชธานีได้ดำเนินการซ่อมแซมหอไตรวัดมหาธาตุอีกครั้ง
กรมศิลปากรได้ประกาศขึ้นทะเบียนหอไตรวัดมหาธาตุเป็นโบราณสถาน ในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 65 ตอนที่ 43 หน้า 2220 – 2221 ลงวันที่ 27 กรกฎาคม พ.ศ. 2491 และประกาศกำหนดเขตที่ดินโบราณสถาน ในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 98 ตอนที่ 104 หน้าที่ 2026 ลงวันที่ 30 มิถุนายน พ.ศ. 2524 โดยกำหนดเนื้อที่ โบราณสถาน 2 ไร่ 1 งาน 44 ตารางวา